Infections du système gastro-intestinal

Virus : Sapovirus GI/GII/GIV/GV, adénovirus, Astrovirus, Norovirus GI/GII, Rotavirus A
Bactéries Gram+ : toxine A de Clostridium difficile, toxine B de Clostridium difficile, toxine binaire A/B de Clostridium difficile
Bactéries Gram- : Plesiomonas shigelloides, Salmonella spp., Campylobacter spp., Vibrio parahaemolyticus, Vibrio cholerae, Vibrio vulnificus, Shigella/E. coli entéroinvasif (EIEC), E. coli entéroagrégatif (EAEC), E. coli producteur de toxine de Shiga (STEC), E. coli entéropathogène (EPEC), E. coli entérotoxinogène (ETEC), Yersinia enterocolitica
Parasites : Giardia lamblia, Entamoeba histolytica, Cryptosporidium spp., Cyclospora cayetanensis